Magie axetat thường được sử dụng làm nguồn cung cấp magiê hoặc ion axetat trong các thí nghiệm hóa học.
Một trong những ứng dụng phổ biến hơn của magie axetat là trong hỗn hợp được gọi là canxi magie axetat (CMA). Nó là một hỗn hợp của canxi axetat và magie axetat. CMA được coi như một chất thay thế thân thiện với môi trường cho NaCl và CaCl2. CMA cũng hoạt động như một chất kiểm soát phát thải khí SO2, NOx và các hạt độc hại mạnh mẽ trong quá trình đốt than để giảm mưa axit, và như một chất xúc tác hiệu quả để thúc đẩy quá trình đốt than.
Khi magie axetat được trộn với hydrogen peroxide, nó hoạt động như một chất diệt khuẩn.
Magie axetat đã được chứng minh là có hiệu quả tro hóa các hợp chất hữu cơ để chuẩn bị phân tích flo khi nồng độ flo cao hoặc thấp.